Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTGER1P34995 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER1P34995 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms