Protein–RNA interactions for Protein: P32842

VMA11, V-type proton ATPase subunit c', yeast

Predictions only

Length 164 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VMA11	P32842	SPO7	YAL009W	780 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	RHO4	YKR055W	876 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	TSA1	YML028W	591 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	WHI2	YOR043W	1461 nt		4.92	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	SES1	YDR023W	1389 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	ISN1	YOR155C	1353 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	SPS22	YCL048W	1392 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	DON1	YDR273W	1098 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	YML6	YML025C	861 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	AIM33	YML087C	939 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	CIN4	YMR138W	576 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	MRPS5	YBR251W	924 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	SCT1	YBL011W	2280 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	TRP5	YGL026C	2124 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	AFG1	YEL052W	1530 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	YFL052W	YFL052W	1398 nt		4.91	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	TPO3	YPR156C	1869 nt		4.9	□□□□□ -1.62
VMA11	P32842	COX20	YDR231C	618 nt		4.9	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	YHR070C-A	YHR070C-A	411 nt		4.9	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	GEX1	YCL073C	1848 nt		4.9	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	GEX2	YKR106W	1848 nt		4.9	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	PYK2	YOR347C	1521 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	DMA1	YHR115C	1251 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	YPR114W	YPR114W	948 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	RPL21A	YBR191W	483 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	CDC16	YKL022C	2523 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	PDR18	YNR070W	4002 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	COR1	YBL045C	1374 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	YTP1	YNL237W	1380 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	TKL1	YPR074C	2043 nt		4.89	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	MTC5	YDR128W	3447 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	YDL022C-A	YDL022C-A	249 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	YML012C-A	YML012C-A	378 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	CPA1	YOR303W	1236 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	PGM1	YKL127W	1713 nt		4.88	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	RAD24	YER173W	1980 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	FAT3	YKL187C	2253 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	MTC2	YKL098W	1074 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	SNO4	YMR322C	714 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	HSP33	YOR391C	714 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	HSP32	YPL280W	714 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	ATG12	YBR217W	561 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	HSP104	YLL026W	2727 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	CMR1	YDL156W	1569 nt		4.87	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	ALT1	YLR089C	1779 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	HAP3	YBL021C	435 nt		4.86	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	RPN11	YFR004W	921 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	BCY1	YIL033C	1251 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	YMR119W-A	YMR119W-A	375 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	YHM2	YMR241W	945 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	BSC4	YNL269W	396 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	CRP1	YHR146W	1398 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	MRK1	YDL079C	1506 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	ARG81	YML099C	2643 nt		4.85	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	GAA1	YLR088W	1845 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	IMA2	YOL157C	1770 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	BUD9	YGR041W	1644 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	GUD1	YDL238C	1470 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	HST3	YOR025W	1344 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	YGL235W	YGL235W	537 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	tR(ACG)D	tR(ACG)D	73 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	tR(ACG)E	tR(ACG)E	73 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	tR(ACG)K	tR(ACG)K	73 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	tR(ACG)L	tR(ACG)L	73 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	tR(ACG)O	tR(ACG)O	73 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	AAD15	YOL165C	432 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	PUF3	YLL013C	2640 nt		4.84	□□□□□ -1.63
VMA11	P32842	CHS5	YLR330W	2016 nt		4.84	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	RNR3	YIL066C	2610 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	CDC19	YAL038W	1503 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	MAK32	YCR019W	1092 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	YDL119C	YDL119C	924 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	COA1	YIL157C	594 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	YIR042C	YIR042C	711 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	RPE1	YJL121C	717 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	SSP120	YLR250W	705 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	MSN2	YMR037C	2115 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	UBC11	YOR339C	471 nt		4.83	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	MSS1	YMR023C	1581 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	ATG4	YNL223W	1485 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	IRS4	YKR019C	1848 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	YDR278C	YDR278C	318 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	CBP4	YGR174C	513 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	DAP1	YPL170W	459 nt		4.82	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	YDR514C	YDR514C	1452 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	YIR007W	YIR007W	2295 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	MCM6	YGL201C	3054 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	COX9	YDL067C	180 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	VPS61	YDR136C	573 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	DUS4	YLR405W	1104 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	MRPS12	YNR036C	462 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	RSC30	YHR056C	2652 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	KKQ8	YKL168C	2175 nt		4.81	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	FLC3	YGL139W	2409 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	PHB1	YGR132C	864 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	RPR2	YIR015W	435 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	ICS3	YJL077C	396 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	CDC11	YJR076C	1248 nt		4.8	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	EMW1	YNL313C	2715 nt		4.79	□□□□□ -1.64
VMA11	P32842	RPL10	YLR075W	666 nt		4.79	□□□□□ -1.64

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