Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLDCP23378 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLDCP23378 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLDCP23378 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLDCP23378 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GLDCP23378 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLDCP23378 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLDCP23378 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLDCP23378 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLDCP23378 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLDCP23378 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GLDCP23378 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLDCP23378 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLDCP23378 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GLDCP23378 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLDCP23378 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLDCP23378 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLDCP23378 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GLDCP23378 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLDCP23378 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLDCP23378 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLDCP23378 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GLDCP23378 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLDCP23378 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLDCP23378 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLDCP23378 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GLDCP23378 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLDCP23378 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLDCP23378 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLDCP23378 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GLDCP23378 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GLDCP23378 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLDCP23378 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLDCP23378 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLDCP23378 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLDCP23378 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLDCP23378 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GLDCP23378 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLDCP23378 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GLDCP23378 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLDCP23378 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLDCP23378 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLDCP23378 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLDCP23378 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GLDCP23378 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GLDCP23378 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLDCP23378 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLDCP23378 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLDCP23378 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GLDCP23378 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLDCP23378 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLDCP23378 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLDCP23378 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLDCP23378 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLDCP23378 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLDCP23378 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLDCP23378 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GLDCP23378 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GLDCP23378 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLDCP23378 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLDCP23378 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLDCP23378 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GLDCP23378 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLDCP23378 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GLDCP23378 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLDCP23378 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GLDCP23378 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLDCP23378 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLDCP23378 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLDCP23378 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLDCP23378 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLDCP23378 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GLDCP23378 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLDCP23378 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLDCP23378 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLDCP23378 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLDCP23378 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLDCP23378 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GLDCP23378 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLDCP23378 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLDCP23378 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLDCP23378 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLDCP23378 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLDCP23378 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GLDCP23378 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLDCP23378 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GLDCP23378 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLDCP23378 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLDCP23378 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLDCP23378 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLDCP23378 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GLDCP23378 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLDCP23378 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLDCP23378 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GLDCP23378 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLDCP23378 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GLDCP23378 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GLDCP23378 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLDCP23378 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GLDCP23378 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms