Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
HRCP23327 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37■■■■□ 3.51
HRCP23327 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
HRCP23327 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
HRCP23327 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37■■■■□ 3.51
HRCP23327 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
HRCP23327 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37■■■■□ 3.51
HRCP23327 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
HRCP23327 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
HRCP23327 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HRCP23327 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HRCP23327 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HRCP23327 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
HRCP23327 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
HRCP23327 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
HRCP23327 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
HRCP23327 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
HRCP23327 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
HRCP23327 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
HRCP23327 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
HRCP23327 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
HRCP23327 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
HRCP23327 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
HRCP23327 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
HRCP23327 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
HRCP23327 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
HRCP23327 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
HRCP23327 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
HRCP23327 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
HRCP23327 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
HRCP23327 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
HRCP23327 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
HRCP23327 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
HRCP23327 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
HRCP23327 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
HRCP23327 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
HRCP23327 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
HRCP23327 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
HRCP23327 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
HRCP23327 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
HRCP23327 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
HRCP23327 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
HRCP23327 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
HRCP23327 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
HRCP23327 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
HRCP23327 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
HRCP23327 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
HRCP23327 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
HRCP23327 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
HRCP23327 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
HRCP23327 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
HRCP23327 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
HRCP23327 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.5
HRCP23327 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
HRCP23327 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
HRCP23327 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
HRCP23327 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
HRCP23327 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
HRCP23327 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
HRCP23327 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
HRCP23327 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
HRCP23327 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
HRCP23327 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
HRCP23327 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
HRCP23327 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
HRCP23327 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
HRCP23327 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
HRCP23327 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
HRCP23327 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
HRCP23327 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
HRCP23327 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
HRCP23327 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
HRCP23327 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
HRCP23327 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
HRCP23327 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
HRCP23327 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
HRCP23327 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
HRCP23327 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
HRCP23327 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HRCP23327 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HRCP23327 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HRCP23327 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
HRCP23327 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HRCP23327 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HRCP23327 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
HRCP23327 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HRCP23327 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HRCP23327 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
HRCP23327 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
HRCP23327 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
HRCP23327 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
HRCP23327 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC36.79■■■■□ 3.48
HRCP23327 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
HRCP23327 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
HRCP23327 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
HRCP23327 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
HRCP23327 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
HRCP23327 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
HRCP23327 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
HRCP23327 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms