Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CDK11BP21127 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CDK11BP21127 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CDK11BP21127 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms