Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB42P16452 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB42P16452 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EPB42P16452 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB42P16452 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB42P16452 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB42P16452 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB42P16452 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB42P16452 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB42P16452 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EPB42P16452 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB42P16452 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB42P16452 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB42P16452 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB42P16452 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB42P16452 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EPB42P16452 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB42P16452 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB42P16452 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB42P16452 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB42P16452 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB42P16452 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB42P16452 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB42P16452 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB42P16452 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EPB42P16452 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPB42P16452 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EPB42P16452 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB42P16452 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB42P16452 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB42P16452 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB42P16452 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB42P16452 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB42P16452 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB42P16452 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB42P16452 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB42P16452 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EPB42P16452 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPB42P16452 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPB42P16452 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPB42P16452 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPB42P16452 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPB42P16452 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB42P16452 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB42P16452 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB42P16452 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB42P16452 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB42P16452 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB42P16452 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB42P16452 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB42P16452 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPB42P16452 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPB42P16452 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPB42P16452 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPB42P16452 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPB42P16452 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPB42P16452 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPB42P16452 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPB42P16452 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPB42P16452 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPB42P16452 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB42P16452 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB42P16452 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB42P16452 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB42P16452 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB42P16452 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPB42P16452 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB42P16452 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB42P16452 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB42P16452 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB42P16452 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB42P16452 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB42P16452 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPB42P16452 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB42P16452 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB42P16452 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB42P16452 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB42P16452 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB42P16452 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB42P16452 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB42P16452 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB42P16452 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB42P16452 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPB42P16452 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB42P16452 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB42P16452 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB42P16452 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB42P16452 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB42P16452 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EPB42P16452 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB42P16452 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB42P16452 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB42P16452 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB42P16452 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB42P16452 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB42P16452 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EPB42P16452 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPB42P16452 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPB42P16452 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EPB42P16452 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms