Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTCP00480 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
OTCP00480 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTCP00480 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTCP00480 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTCP00480 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTCP00480 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTCP00480 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTCP00480 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTCP00480 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTCP00480 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTCP00480 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTCP00480 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTCP00480 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTCP00480 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTCP00480 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTCP00480 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTCP00480 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTCP00480 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTCP00480 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTCP00480 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTCP00480 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTCP00480 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTCP00480 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTCP00480 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
OTCP00480 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTCP00480 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTCP00480 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
OTCP00480 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTCP00480 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTCP00480 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTCP00480 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTCP00480 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTCP00480 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTCP00480 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTCP00480 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTCP00480 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
OTCP00480 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTCP00480 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTCP00480 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTCP00480 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTCP00480 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTCP00480 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTCP00480 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTCP00480 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTCP00480 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OTCP00480 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTCP00480 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTCP00480 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTCP00480 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTCP00480 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTCP00480 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTCP00480 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTCP00480 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTCP00480 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OTCP00480 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTCP00480 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTCP00480 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTCP00480 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTCP00480 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTCP00480 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTCP00480 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTCP00480 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTCP00480 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTCP00480 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTCP00480 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTCP00480 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTCP00480 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTCP00480 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTCP00480 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OTCP00480 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OTCP00480 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTCP00480 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTCP00480 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTCP00480 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTCP00480 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTCP00480 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTCP00480 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTCP00480 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTCP00480 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTCP00480 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTCP00480 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTCP00480 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTCP00480 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTCP00480 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTCP00480 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTCP00480 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTCP00480 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTCP00480 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTCP00480 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTCP00480 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTCP00480 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTCP00480 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTCP00480 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTCP00480 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTCP00480 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTCP00480 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTCP00480 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTCP00480 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTCP00480 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.4 ms