Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TNFRSF6BO95407 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms