Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBE4BO95155 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBE4BO95155 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
UBE4BO95155 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms