Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RASSF9O75901 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RASSF9O75901 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms