Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF40O75150 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF40O75150 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF40O75150 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RNF40O75150 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF40O75150 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF40O75150 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF40O75150 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF40O75150 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF40O75150 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF40O75150 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RNF40O75150 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF40O75150 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF40O75150 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF40O75150 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF40O75150 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF40O75150 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF40O75150 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF40O75150 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RNF40O75150 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF40O75150 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF40O75150 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF40O75150 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF40O75150 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF40O75150 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF40O75150 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RNF40O75150 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF40O75150 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF40O75150 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF40O75150 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF40O75150 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF40O75150 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF40O75150 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF40O75150 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF40O75150 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RNF40O75150 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF40O75150 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF40O75150 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF40O75150 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF40O75150 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF40O75150 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF40O75150 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF40O75150 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RNF40O75150 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF40O75150 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF40O75150 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF40O75150 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF40O75150 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF40O75150 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF40O75150 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF40O75150 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF40O75150 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF40O75150 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RNF40O75150 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF40O75150 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF40O75150 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RNF40O75150 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF40O75150 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF40O75150 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF40O75150 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF40O75150 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF40O75150 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF40O75150 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF40O75150 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF40O75150 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RNF40O75150 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF40O75150 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF40O75150 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF40O75150 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF40O75150 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RNF40O75150 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF40O75150 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF40O75150 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF40O75150 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF40O75150 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RNF40O75150 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF40O75150 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF40O75150 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF40O75150 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF40O75150 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF40O75150 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF40O75150 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF40O75150 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF40O75150 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF40O75150 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RNF40O75150 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF40O75150 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF40O75150 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RNF40O75150 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF40O75150 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF40O75150 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF40O75150 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF40O75150 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF40O75150 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RNF40O75150 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RNF40O75150 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RNF40O75150 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF40O75150 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RNF40O75150 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF40O75150 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms