Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF13O43567 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF13O43567 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF13O43567 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF13O43567 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF13O43567 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF13O43567 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF13O43567 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF13O43567 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF13O43567 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF13O43567 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF13O43567 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF13O43567 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF13O43567 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF13O43567 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF13O43567 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF13O43567 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF13O43567 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF13O43567 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF13O43567 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF13O43567 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF13O43567 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF13O43567 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF13O43567 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF13O43567 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF13O43567 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF13O43567 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF13O43567 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF13O43567 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF13O43567 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF13O43567 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF13O43567 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF13O43567 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF13O43567 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF13O43567 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF13O43567 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF13O43567 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF13O43567 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF13O43567 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF13O43567 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF13O43567 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF13O43567 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF13O43567 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF13O43567 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF13O43567 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF13O43567 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF13O43567 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF13O43567 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF13O43567 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF13O43567 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF13O43567 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF13O43567 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF13O43567 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF13O43567 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RNF13O43567 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF13O43567 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF13O43567 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF13O43567 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF13O43567 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF13O43567 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF13O43567 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF13O43567 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RNF13O43567 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF13O43567 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF13O43567 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF13O43567 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RNF13O43567 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF13O43567 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF13O43567 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF13O43567 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF13O43567 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF13O43567 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF13O43567 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF13O43567 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF13O43567 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RNF13O43567 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF13O43567 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF13O43567 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF13O43567 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF13O43567 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF13O43567 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RNF13O43567 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RNF13O43567 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RNF13O43567 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms