Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
OIP5O43482 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OIP5O43482 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
OIP5O43482 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OIP5O43482 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OIP5O43482 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OIP5O43482 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OIP5O43482 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OIP5O43482 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
OIP5O43482 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
OIP5O43482 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OIP5O43482 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OIP5O43482 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
OIP5O43482 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OIP5O43482 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OIP5O43482 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OIP5O43482 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
OIP5O43482 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OIP5O43482 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OIP5O43482 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
OIP5O43482 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OIP5O43482 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OIP5O43482 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OIP5O43482 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OIP5O43482 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OIP5O43482 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
OIP5O43482 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OIP5O43482 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OIP5O43482 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OIP5O43482 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OIP5O43482 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OIP5O43482 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OIP5O43482 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OIP5O43482 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OIP5O43482 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OIP5O43482 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OIP5O43482 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OIP5O43482 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OIP5O43482 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OIP5O43482 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OIP5O43482 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OIP5O43482 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
OIP5O43482 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OIP5O43482 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OIP5O43482 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OIP5O43482 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
OIP5O43482 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
OIP5O43482 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OIP5O43482 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OIP5O43482 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OIP5O43482 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OIP5O43482 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OIP5O43482 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OIP5O43482 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OIP5O43482 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OIP5O43482 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
OIP5O43482 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OIP5O43482 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OIP5O43482 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OIP5O43482 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
OIP5O43482 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OIP5O43482 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OIP5O43482 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OIP5O43482 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OIP5O43482 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OIP5O43482 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OIP5O43482 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OIP5O43482 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OIP5O43482 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OIP5O43482 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OIP5O43482 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OIP5O43482 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OIP5O43482 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OIP5O43482 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OIP5O43482 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
OIP5O43482 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
OIP5O43482 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OIP5O43482 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OIP5O43482 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OIP5O43482 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OIP5O43482 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OIP5O43482 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OIP5O43482 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OIP5O43482 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OIP5O43482 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OIP5O43482 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OIP5O43482 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OIP5O43482 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OIP5O43482 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OIP5O43482 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OIP5O43482 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OIP5O43482 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OIP5O43482 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OIP5O43482 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OIP5O43482 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
OIP5O43482 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OIP5O43482 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OIP5O43482 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OIP5O43482 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OIP5O43482 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms