Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTIFO43310 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTIFO43310 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTIFO43310 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CTIFO43310 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTIFO43310 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTIFO43310 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTIFO43310 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTIFO43310 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTIFO43310 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTIFO43310 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTIFO43310 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTIFO43310 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTIFO43310 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTIFO43310 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTIFO43310 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTIFO43310 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTIFO43310 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CTIFO43310 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTIFO43310 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTIFO43310 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTIFO43310 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTIFO43310 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTIFO43310 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTIFO43310 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTIFO43310 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTIFO43310 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTIFO43310 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTIFO43310 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTIFO43310 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTIFO43310 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTIFO43310 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTIFO43310 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CTIFO43310 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTIFO43310 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTIFO43310 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTIFO43310 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTIFO43310 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTIFO43310 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTIFO43310 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTIFO43310 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTIFO43310 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTIFO43310 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTIFO43310 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTIFO43310 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTIFO43310 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTIFO43310 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTIFO43310 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTIFO43310 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTIFO43310 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTIFO43310 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTIFO43310 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTIFO43310 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTIFO43310 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTIFO43310 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTIFO43310 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CTIFO43310 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTIFO43310 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTIFO43310 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTIFO43310 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTIFO43310 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTIFO43310 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTIFO43310 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTIFO43310 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTIFO43310 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTIFO43310 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTIFO43310 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTIFO43310 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTIFO43310 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTIFO43310 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTIFO43310 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTIFO43310 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTIFO43310 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTIFO43310 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTIFO43310 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTIFO43310 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTIFO43310 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTIFO43310 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTIFO43310 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTIFO43310 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTIFO43310 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTIFO43310 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTIFO43310 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTIFO43310 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTIFO43310 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTIFO43310 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTIFO43310 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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