Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
UBXN8O00124 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBXN8O00124 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBXN8O00124 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149 ms