Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMIM22K7EJ46 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMIM22K7EJ46 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms