Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TCAF2A6NFQ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TCAF2A6NFQ2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TCAF2A6NFQ2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TCAF2A6NFQ2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms