Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC13A5PLN9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC13A5PLN9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC13A5PLN9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC13A5PLN9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC13A5PLN9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC13A5PLN9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC13A5PLN9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAPPC13A5PLN9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC13A5PLN9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms