Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms