Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
DTX4Q9Y2E6 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DTX4Q9Y2E6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms