Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEFF2Q9UIK5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms