Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms