Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM5BQ9UGL1 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KDM5BQ9UGL1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms