Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
DKK2Q9UBU2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms