Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RRBP1Q9P2E9 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms