Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHRF1Q9P1Y6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHRF1Q9P1Y6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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