Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LIN28AQ9H9Z2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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