Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000534.1-201ENST00000444162 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC013439.1-201ENST00000449965 1239 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021146.11-201ENST00000503319 491 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CARD8-214ENST00000520007 614 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003692.1-201ENST00000521706 796 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL132640.1-201ENST00000559594 619 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ONECUT1-202ENST00000560699 996 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS20P22-202ENST00000488192 1318 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNASE4-201ENST00000397995 853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
KRTAP9-3Q9BYQ3 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms