Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GSDMCQ9BYG8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GSDMCQ9BYG8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms