Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SALL3Q9BXA9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms