Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MCMBPQ9BTE3 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms