Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SGIP1Q9BQI5 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms