Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ELF4Q99607 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms