Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SLC22A12Q96S37 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms