Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
BORCS6Q96GS4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BORCS6Q96GS4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms