Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
STAMBPL1Q96FJ0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
STAMBPL1Q96FJ0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms