Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HGDQ93099 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HGDQ93099 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms