Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
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PTPRUQ92729 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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PTPRUQ92729 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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PTPRUQ92729 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
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PTPRUQ92729 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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PTPRUQ92729 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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PTPRUQ92729 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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PTPRUQ92729 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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PTPRUQ92729 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
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PTPRUQ92729 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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PTPRUQ92729 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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PTPRUQ92729 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
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PTPRUQ92729 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRUQ92729 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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