Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
APOBEC4Q8WW27 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
APOBEC4Q8WW27 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms