Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GPBAR1Q8TDU6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GPBAR1Q8TDU6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms