Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HJURPQ8NCD3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms