Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CATSPER4Q7RTX7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms