Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP31Q70CQ4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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