Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
GARNL3Q5VVW2 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms