Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTSL3PQ5NE16 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms