Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RFTN2Q52LD8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms