Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HLA-BQ31612 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HLA-BQ31612 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms