Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SKOR2Q2VWA4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SKOR2Q2VWA4 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms