Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms