Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SGSM1Q2NKQ1 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SGSM1Q2NKQ1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms